Dans les earthships un des principes fondamentaux repose sur le circuit de l’eau. L’eau étant un élément vital, doit toujours être en suffisance dans la maison. Celle-ci est récupérée du ciel et elle est ensuite filtrée pour un maximum de quatre utilisations avant d’être évacuée naturellement. Attention, cette eau ne deviendra jamais de l’eau potable. Depuis le toit, l’eau subit d’abord, une grossière filtration au travers d’un limon de graviers et est canalisée à travers les liaisons de drain de gravier vers les citernes. Stockée dans des bacs de rétention (dimensionnés selon les besoins liés à la localisation), l’eau est à l’abri des rayons du soleil. La citerne est munie d’une pompe et d’un filtre. L’eau est poussée par la pompe vers d’autres filtres qui vont finalisés son état. Propre, celle-ci sert à un usage quotidien, comme la douche ou la vaisselle, à l’exception des toilettes. Les eaux grises sont récupérées, filtrées à nouveau par des cellules botaniques intérieures et réutilisées pour les sanitaires (la chasse d’eau). Les eaux grises deviennent des eaux noires, elles sont séparés du système de drainage et de la plomberie domestiques pour être traitée une dernière et quatrième fois dans des cellules botaniques extérieures.